На сколько помню, при обмене данными между узлами РИБ измения конфигурации приходят вместе с пакетами данных. В типовых конфигурациях это все уже реализовано. Все проиходит в два этапа: 1 сперва применяются изменения конфигурации 2 выполняется обмен данными
Можно прописать чтобы при получении обмена с изменениями конфы конфа автоматически перезапускалась, применались изменения и заново запускался нормальны режим.